In AnthonyDEBUR/tools4DCE: Tools for rivers water quality monitoring

knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)

Lancer Rstudio et charger la library tools4DCE

library("tools4DCE")

Calculer une somme de pesticides à partir de fichiers excel

Formater le fichier EXCEL de la manière suivante:

Dans un onglet intitulé : DATA

1ère ligne du fichier = ligne de titre lignes suivantes = données

Les données sont regroupées par colonnes. Les intitulés suivants dans les colonnes sont obligatoires (attention, R différencie majuscules et minuscules).

• CdStationMesureEauxSurface : code SANDRE des stations de mesure
• CdSupport : code SANDRE du support d'analyse (3 pour eau)
• CdFractionAnalysee : code SANDRE de la fraction analysée
• DatePrel : date du prélèvement
• CdParametre : code SANDRE du paramètre
• CdUniteMesure : code SANDRE de l'unité de mesure
• CdRqAna : code remarque selon la nomenclature du SANDRE
• LqAna : limite de quantification

Nota : si certaines colonnes sont vides, il faut néanmoins prévoir le nom de colonne dans le fichier, tout en laissant la colonne vide.

Un fichier exemple est téléchargeable au lien suivant : https://github.com/AnthonyDEBUR/tools4DCE/raw/4b606165757d2db58511de15b9d886f7e19473d7/demonstration/exemple.xlsx

Charger le fichier excel en mémoire

La commande "file.choose()" ouvre une fenêtre permettant de sélectionner un fichier. Sélectionner le fichier excel avec les résultats.

La commande read_excel permet de charger le contenu du fichier (onglet DATA) en mémoire sous R

donnees<-read_xlsx("https://github.com/AnthonyDEBUR/tools4DCE/raw/4b606165757d2db58511de15b9d886f7e19473d7/demonstration/exemple.xlsx", sheet = "DATA")

str(donnees)

AnthonyDEBUR/tools4DCE documentation built on June 10, 2025, 8:56 a.m.